R blogdown 搭建个人博客或科研网站

本文收录在《学 R 》一书的附录中。

互联网时代有个自己的网站,就好像真实世界里有了自己的房子(服务器)和固定地址(域名);自我介绍时附上自己的网站,就像生活里邀请朋友来访或者职场上递上名片,都甚为方便。然而,建立一个网站并不容易,涉及诸多领域的知识和技能,门槛比较高。好在,我们有万能的R语言,搭建网站只需几分钟,而并不需要多少网络知识。你甚至不用懂 R 语言是什么,照我下面说的做就行,包教包会,学不会免费再教。

这里,我提供两个示范,演示如何使用 R 语言的 blogdown 扩展包1,用来搭建一个个人博客和一个科研小组网站。截至本文成稿之日,blogdown 含苞待放,尚未正式发布,但是已经能够正常安装使用了。我们来尝尝鲜,提前一睹她的芳容。

R blogdown 简介和安装

R blogdown 是什么

  • R语言的一个扩展包,用来制作网站的工具。
  • 可以用非常简洁的方式快速搭建静态网页构成的网站。
  • 虽然名字里有“博客”(blog)字样,但并不仅限于博客。非常适合搭建一个科研小组的展示窗口。
  • 基于 markdown 扩展语法,可以在网页中方便地插入图表、脚注、数学公式、R 代码等元素。
  • 非常容易将 bookdown 生成的论文转化成网页展示。
  • 非常易于维护,迁移,备份。

本书的官方网站就是用 R blogdown 搭建的。网站里给大家提供的 R 示例代码、试读章节、勘误表等,都是直接从书稿中拷贝粘贴到文本文件里,然后运行一下 blogdown 的指令,网站就自动更新了。

安装

blogdown 的背景平台是 R 语言,用户界面首选 RStudio ,产生的网站框架是 Hugo ,掰手指头数一数,要安装4样东西,略显繁琐,但并不难,一劳永逸。安装方式如下:

  • R。去R的服务器CRAN,点击Download R for Windows(其他操作系统的用户请自便),在打开的新网页最上方点击base,就找到下载链接了。下载完毕后安装,一路“下一步”的傻瓜式安装即可。
  • RStudio。去官网下载安装文件运行即可。
  • blogdown。运行RStudio,在左上面板的代码窗口输入并运行以下代码:
if(!require(devtools)) install.packages('devtools')
devtools::install_github('rstudio/blogdown')

解释一下:由于 blogdown 目前只发布到了 GitHub 服务器上,尚未发布到CRAN,所以上面第一条代码先安装开发工具 devtools 包,第二行用这个包的install_github() 函数从 GitHub 安装。

  • Hugo 框架。在 RStudio 左上面板的代码窗口输入并运行以下代码:
blogdown::install_hugo()

安装完毕。

用 R blogdown 搭建个人博客

创建示例网站

我在自己博客建立了个子站,作为 R blogdown 个人博客的示例。下面我们看看这个博客是如何创建的。

首先,在你的电脑里新建一个文件夹,准备存放网站文件,假定是c:\blogdown_default,那么创建网站只需在RStudio里运行两行代码:

setwd('c:\\blogdown_default')
blogdown::new_site()

示例网站搭建完毕。对,就这么简单!

c:\blogdown_default看看吧,出现了好多新文件夹。别的不用管也不用动,只注意content\public\ 这两个就行了。打开 public\index.html,这就是网站的主页。随便点开上面的几个链接试试看。

发布到网上

上面搭建的网站,目前只存在于本地电脑里,下面我们发布到网上。

如果你像我一样,已经有了自己租用的服务器,上面有了WordPress博客,那最简单,在服务器的public_html\文件夹下面创建一个新文件夹,例如叫做test,那么只需将刚刚在本地新建的博客或科研网站的 public文件夹里所有文件上传到服务器的test 文件夹即可。访问你的域名/test,就可以看到新网站了!

如果你没有自己的服务器,那么最简单的是在 netlify 免费注册个账号,然后按提示将你本地的 public\ 文件夹拖进去,会自动布署,等几分钟,就可以访问了。你可以免费申请个子域名,也可以买个自己的域名绑定上去。我已经申请了一个,打算作为自己的科研主页。这是从blogdown 创建的科研网站示例(创建方法见下文)修改而来的,而且还没改完,里面的英文内容都是示例里别人的工作。

那么,如何将自动生成的网站更新成自己的,并添加新内容呢?

网站更新

前文提醒你注意,新建的网站文件夹里有个content\文件夹。这里就是更新网站内容的地方。你只需用记事本或RStudio,打开其中的.md.Rmd 文件,修改成自己的内容后保存,然后运行建站函数:

blogdown::build_site()

这样,public\ 就自动更新了,再发布到网上即可。

.md.Rmd 文件使用 markdown语法,见我以前写的帖子:

如果要发表新帖子,那么有两种方式最简单:

  • 方法一:将原有的.md.Rmd拷贝粘贴,改一下标题和内容即可;
  • 方法二:在RSudio代码窗口点击 Addins- New Post, 按提示填写即可。

写完保存,运行建站函数,上传。完毕。

自动同步

也许你嫌每次更新上传太麻烦。我们当然可以选择自动同步。

如果网站搭建在Netlify,那么只需做三件事:

  1. 下载并安装 GitHub 客户端,申请个免费账号,并创建一个项目,例如叫做myweb,将前面我们举例的c:\blogdown_default 文件夹设为项目的文件夹,并同步到云端。
  2. 在你的Netlify设置里,设为自动跟你的GitHub里的myweb项目同步,同步内容是 public文件夹。
  3. 以后每次更新并运行完建站函数后,在GitHub客户端同步一下即可。

用 R blogdown 搭建科研网站

上文说到,我申请了一个Netlify免费账号,并且创建了自己的科研主页,是从blogdown 创建的科研网站示例修改而来的。这个示例的本来面貌可以来我博客上看:科研网站的示例。这个科研网站的构架比个人博客复杂,有简介、新闻、发表论文、科研项目等基本模块,还可以根据需要新增,非常适合作为科研小组的展示窗口。

这个网站的搭建也很简单,跟个人博客类似。在你的电脑里新建文件夹,比如 c:\blogdown_academic,在RStudio里运行两行代码:

setwd('c:\\blogdown_default')
blogdown::new_site(theme='gcushen/hugo-academic')

c:\blogdown_academic 看看吧,科研网站搭建完毕!

但是,如果你这时双击打开c:\blogdown_academic\public\index.html 的话,会发现界面并不好看(css未载入),并且点击页面的那些链接也无效。别急,我们再做个小改动就行了。

用记事本将c:\blogdown_academic\config.toml 打开,删掉第一行,然后添加下面两行并保存文件。

baseurl = "/"
relativeurls = true

然后在RStudio运行建站函数build_site()

blogdown::build_site()

好了,现在可以打开c:\blogdown_academic\public\index.html 正常浏览了!

解释一下:config.toml 文件里的默认设置不支持本地浏览,而且发布到网上时需要布署。这里改成相对路径relativeurls = true,就可以直接在本地打开 index.html 浏览了。

其他的发布、更新、同步,跟前文讲述的一致,这里不再赘述。需要特别指出的是,科研网站示例的首页,个人信息需要在前面提到的config.toml里的[params] 修改。

这里的科研网站示例,使用的是Hugo-academic主题。Hugo还有很多其他主题可以使用。我们相信,只要深入研究一下,一定可以搭建让人更合心意的网站。同时,blogdown也在进一步完善中,让我们期待她的盛装绽放吧!


  1. Yihui Xie. blogdown: Create Blogs and Websites with R Markdown. R package version 0.0.24.

comments powered by Disqus